La Dirección General de Epidemiología y Salud Ambiental tiene por objeto asistir a las autoridades sanitarias en relación a la información del estado de situación para la toma de decisiones en lo respectivo a eventos vigilados y daños a la salud de la población, promoviendo estrategias e intervenciones que contribuyan con la prevención y disminución de los riesgos colectivos que afecten la salud y la calidad de vida de la población de la Provincia.

Esta Dirección funciona coordinando la articulación de las labores de sus cuatro dependencias interrelacionando información proveniente de la Dirección de Epidemiología e Información en Salud, la Dirección de Registro y Control de Alimentos, la Dirección de Salud Ambiental y la Dirección de Laboratorio de Salud Pública. Estas áreas con funciones específicas tienen en común, la vigilancia y el control de algunas enfermedades de notificación obligatoria, algunas de ellas con diagnósticos laboratoriales puntuales, con fuentes de contagio alimentaria, animal y/o ambiental, teniendo en gran medida correlación con los efectores de salud públicos y privados.