Dirección General de Salud Digital.

• Dirección de Calidad.
• Dirección de Infraestructura.
• Dirección de Tecnologías de la Información y Comunicaciones.
• Dirección de Sistema e Implementación.

Dirección General de Higiene y Seguridad en el Trabajo.  

• Dirección de Higiene y Seguridad en el Trabajo.

• Dirección de Fiscalización Sanitaria Zona Norte.
• Dirección de Fiscalización Sanitaria Zona Sur.
• Dirección de Medicina del Trabajo Zona Norte.
• Dirección de Medicina del Trabajo Zona Sur.

Dirección General de Prestaciones Médicas y Programas Sociales.

• Dirección de Prestaciones Médicas y Programas Sociales.

Dirección General de Insumos Farmacéuticos.  

• Dirección Técnica.

Dirección General de Epidemiología y Salud Ambiental.  

• Dirección de Salud Ambiental.
• Dirección de Registro y Control de Alimentos.
• Dirección de Epidemiología e Información en Salud.
• Dirección de Laboratorio de Salud Pública.